Республика Коми обладает достаточно высоким инновационным потенциалом, который, тем не менее, имеет значительные препятствия к своей реализации (особенно в периферийных районах) из-за слабого развития инфраструктуры. Основной объем реализуемых инновационных проектов связан с пригородными хозяйствами крупных центров расселения, хотя в последние годы инновационные инвестиционные проекты начали реализовываться и в периферийных районах. Основными факторами, препятствующими осуществлению инновационных проектов, являются неразвитость транспортной и энергетической инфраструктур в регионе, а также недостаток собственных средств для инвестирования у предприятий-заказчиков. Кроме того, население в периферийных районах зачастую не заинтересовано во введении инноваций в сельское хозяйство, поскольку производство здесь находится на достаточном для местного населения уровне. До общего уровня инвестиций в 110 млрд руб. в год сельское хозяйство поддерживается, прежде всего, как социально значимая отрасль, обеспечивающая занятость на местах. При уровне инвестиций в 110-170 млрд руб. в год на местах образуется достаточная занятость, при которой социальная роль сельского хозяйства снижается. Для повышения эффективности инновационной деятельности в АПК Республики Коми предложен территориально ориентированный подход к поддержке инноваций, позволяющий обосновывать формы и объемы государственной поддержки инноваций для сельского хозяйства конкретных территорий Республики Коми, предложены направления решения проблем АПК Республики Коми, обусловленных его особенностями как системы. Экономическая эффективность предложенных мер заключается в оптимизации государственного регулирования направлений и интенсивности инновационных процессов в сельском хозяйстве республики на основе территориально-ориентированного подхода, а также применения новых организационных инструментов такого регулирования.