References

agronauka

Аграрная наука Евро-Северо-Востока

Agricultural Science Euro-North-East

2072-90812500-1396

FARC North-East

agronauka-162

Research Article

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ: ЗООТЕХНИЯ

ОRIGINAL SCIENTIFIC ARTICLES: ZOOTECHNY

Полиморфизм микросателлитных локусов OarCP549, CSRD247, FCB20 и MAF65 у овец

Polymorphism of microsatellite loci OarCP549, CSRD247, FCB20 and MAF65 in sheep

Широкова

Н. В.

Shirokova

N. V.

nadya.shirockowa@yandex.ru

Гетманцева

Л. В.

Getmantseva

L. V.

noemail@neicon.ru

Колосов

Ю. А.

Kolosov

Yu. A.

noemail@neicon.ru

Бакоев

Н. Ф.

Bakoev

N. F.

noemail@neicon.ru

Денискова

Т. Е.

Deniskova

T. E.

noemail@neicon.ru

Бакоев

С. Ю.

Bakoev

S. Yu.

noemail@neicon.ru

Волкова

В. В.

Volkova

V. V.

noemail@neicon.ru

Романец

Т. С.

Romanets

T. S.

noemail@neicon.ru

ФГБОУ ВО Донской ГАУРоссияDonskoj State Agrarian UniversityRussian Federation

ФГБНУ ФНЦ ВИЖ имени Л.К. ЭрнстаРоссияAll-Russian Institute of Animal HusbandryRussian Federation

2017

28102017

055762

2017

Широкова Н.В., Гетманцева Л.В., Колосов Ю.А., Бакоев Н.Ф., Денискова Т.Е., Бакоев С.Ю., Волкова В.В., Романец Т.С.

Shirokova N.V., Getmantseva L.V., Kolosov Y.A., Bakoev N.F., Deniskova T.E., Bakoev S.Y., Volkova V.V., Romanets T.S.

Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.

This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.

https://www.agronauka-sv.ru/jour/article/view/162

Одним из важнейших овцеводческих регионов России, располагающих значительным потенциалом племенных овец, является Ростовская область. В результате многолетней работы селекционеров Ростовской области была создана сальская порода овец. Исследования генетического разнообразия отечественных пород овец становится необходимым условием для их сохранения, дальнейшего совершенствования и использования для нужд современного агропромышленного комплекса РФ. В связи с этим, целью работы было изучить полиморфизм микросателлитных локусов OarCP549, CSRD247, FCB20 и MAF65 у овец сальской породы. Исследования проводили на овцах сальской породы (п = 95, ПЗ «Белозерное», Ростовская обл.). Анализ микросателлитов выполняли на шестнадцатикапиллярном генетическом анализаторе АВ13130х1 Genetic Analyzer. Для оценки полиморфизма локусов учитывали количество аллелей на локус (МА); наблюдаемую (Но) и ожидаемую (Не) гетерозиготность, эффективное число аллелей на локус (Ае). Связь между индивидуальными особями и популяцией в целом определяли на основе индекса фиксации (Fis). Наибольшее количество аллелей (NA=17) и эффективное число аллелей (Ae = 7) у изучаемого поголовья овец было определено по локусу OarCP49. По другим локусам количество аллелей составило 15,12 и 9, эффективное число аллелей 5,56; 5,33 и 3,85 соответственно для CSRD247, FCB20 и MAF65. Дефицит гетерозигот в популяции отмечен по локусам CSRD247 и MAF65. В среднем по четырем локусам индекс фиксации составил 0,094. Результаты представленной работы показали наличие полиморфизма микросателлитных локусов OarCP49, CSRD247, FCB20 и MAF65 и целесообразность их включения в панель ДНК-маркеров для оценки генетического разнообразия и достоверности происхождения овец сальской породы.

Rostov Region is one of the most important regions of sheep breeding in Russia. The Salsk breed of sheep is created as a result of many years work of breeders in the Rostov region. Studies on the genetic diversity of domestic breeds of sheep are a prerequisite for their conservation, further improvement and use for the needs of the modern agro-industrial complex of the Russian Federation. The aim of the work is to study polymorphism of microsatellite loci OarCP549, CSRD247, FCB20, and MAF65 in sheep of Salsk breed. Studies were carried out on sheep of the Salsk breed (n = 95, PZ «Belozernoe», Rostov Region). Analysis of microsatellites was performed on sixteen-capillary genetic analyzer ABI3130xl Genetic Analyzer. To estimate polymorphism of loci it was taken into account: the Number of Alleles per locus (NA); Observed (Ho) and the Expected (He) Heterozygosity, the Effective Number of Alleles per locus (Ae). The highest Number of Alleles (NA = 17) and the Effective Number of Alleles (Ae = 7) was determined from the locus OarCP49 in the sheep of the Salsk breed. At other loci, the Number of Alleles was 15, 12 and 9, and the Effective Number of Alleles was 5.56, 5.33 and 3.85 respectively for CSRD247, FCB20 and MAF65. The heterozygote deficiency in the population is noted at the loci CSRD247 and MAF65. Average index of fixation for four loci was 0.094. The results of the work showed the polymorphism of microsatellite loci OarCP49, CSRD247, FCB20 and MAF65 and the expediency of their inclusion in the panel of DNA markers for assessing the genetic diversity and authenticity of the origin for the sheep of Salsk breed.

генетическое разнообразиемикросателлитыполиморфизмовцысальская порода

OarCP49CSRD247FCB20 и MAF65Genetic diversitymicrosatellitespolymorphismsheepSalsk breedOarCP49CSRD247FCB20 and MAF65

References1

FAO. Guideline for Molecular Genetic Characterisation of Animal Genetic Resources. FAO Animal Production and Health Commission on Genetic Resources for Food and Agriculture. 2011. № 9. Р. 100.

Денискова Т.Е., Селионова М.И., Гладырь Е.А., Доцев А.В. и др. Изменчивость микросателлитов в породах овец, разводимых в России // Сельскохозяйственная биология. 2016. Т.51. № 6. С. 801-810.

Gorlov I.F., Kolosov Yu.A., Shirokova N.V., Getmantseva L.V. и др. Association of the growth hormone gene polymorphism with growth traits in Salsk sheep breed. Small Ruminant Research. 2017. № 150. Р. 11-14.

Колосов Ю.А., Широкова Н.В., Карабиневский А.Н., Приступа В.Н. и др. Повышение эффективности овцеводства // Все о мясе. 2016. № 5. С. 52-55.

Guang-Xin E., Zhong T., Ma Y.-H., Gao H.-J. и др. Conservation genetics in Chinese sheep: diversity of fourteen indigenous sheep (Ovis aries) using microsatellite markers. Ecology and Evolution. 2016. Vol. 6. № 3. Р.810-817.

ISAG. Applied Genetics in Sheep and Goats Workshop. In: 32th International Conference on Animal Genetics. 2010. URL: http://www.isag.us/Docs/Applied_GeneticsSheepGoats_CT.pdf(дата обращения: 10.07.2017).

Kawçcka A., Gurgul A., Miksza-Cybulska A. The use of SNP microarrays for biodiversity studies of sheep - a review. Ann. Anim. Sci. 2016. Vol. 16. № 4. Р. 975-987.

Markin N.V., Usatov A.V., Vasilenko V.N., Klimenko A.I. и др. SSR Analysis of Maternal and Paternal Lines Selected in the Don Region (Russia). American Journal of Agricultural and Biological Science. 2016. Vol. 11. № 1. Р. 13-18.

Kunene N., Ceccobelli S., Di Lorenzo P., Hlo-phe R.S. и др. Genetic diversity in four populations of Nguni (Zulu) sheep assessed by microsatellite analysis. Italian Journal of Animal Science. 2014. Vol. 13. Iss. 1. Р. 76-82.

Yilmaz O., Cemal I., Karaca O. Genetic diversity in nine native Turkish sheep breeds based on microsatellite analysis. Anim Genet. 2014. Vol. 45. № 4. P. 604-608.

Salamon D., Gutierrez-Gil B., Arranz J.J., Barreta J. и др. Genetic diversity and differentiation of 12 eastern Adriatic and western Dinaric native sheep breeds using microsatellites. Animal. 2014. № 8. Р. 200-207.

Souza C.A., Paiva S.R., McManus C.M., Azevedo H.C., Mariante A.S., Grattapaglia D. Genetic diversity and assessment of 23 microsatellite markers for parentage testing of Santa Inês hair sheep in Brazil. Genet. Mol. Res. 2012. № 11. Р. 1217-1229.

Pons A. L., Landi V., Martinez A., Delgado J.V. The biodiversity and genetic structure of Balearic sheep breeds. J. Anim. Breed. Genet. 2015. № 132. Р. 268-276.

Pramod S., Kumarasamy P., Chandra A.R.M., Sridevi P., Rahumathulla P.S. Molecular characterization of vembur sheep (Ovis aries) of South Indiabased on microsatellites. Indian Journal of Science and Technology. 2009. № 2. Р. 55-58.

Кузнецов В.М. F-Райта: оценка и интерпретация // Проблемы биологии продуктивных животных. 2014. № 4. С. 80-104.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.