<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">agronauka</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Аграрная наука Евро-Северо-Востока</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Agricultural Science Euro-North-East</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2072-9081</issn><issn pub-type="epub">2500-1396</issn><publisher><publisher-name>FARC North-East</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.30766/2072-9081.2018.64.3.75-80</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">agronauka-225</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ: ЗООТЕХНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ОRIGINAL SCIENTIFIC ARTICLES: ZOOTECHNY</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Изучение генетического разнообразия и дифференциации региональных популяций романовских овец по микросателлитным маркерам</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Study of genetic diversity and differentiation of regional populations of Romanov sheep using micro satellite markers</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Денискова</surname><given-names>Т. Е.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Deniskova</surname><given-names>T. E.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Костюнина</surname><given-names>О. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kostyunina</surname><given-names>O. V.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Соловьева</surname><given-names>А. Д.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Solovieva</surname><given-names>A. D.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Зиновьева</surname><given-names>Н. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zinovieva</surname><given-names>N. A.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>L.K. Ernst Federal Science Center for Animal Husbandry</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2018</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>28</day><month>06</month><year>2018</year></pub-date><volume>64</volume><issue>3</issue><fpage>75</fpage><lpage>80</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Денискова Т.Е., Костюнина О.В., Соловьева А.Д., Зиновьева Н.А., 2018</copyright-statement><copyright-year>2018</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Денискова Т.Е., Костюнина О.В., Соловьева А.Д., Зиновьева Н.А.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Deniskova T.E., Kostyunina O.V., Solovieva A.D., Zinovieva N.A.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.agronauka-sv.ru/jour/article/view/225">https://www.agronauka-sv.ru/jour/article/view/225</self-uri><abstract><p>Романовская порода овец - это наиболее интересная локальная порода России, обладающая уникальными биологическими особенностями (полиэстричность, многоплодие). Сохранение генетических ресурсов данной породы требует постоянного тщательного мониторинга по ДНК-маркерам. В связи с этим, целью работы было провести сравнение параметров аллелофонда и генетического разнообразия, а также оценить генетическое сходство региональных популяций романовской породы с архетипичными животными. Образцы ткани овец были отобраны в разных регионах России (Ярославской, Рязанской, Тульской областях, республиках Хакасия и Коми). Полиморфизм 11 микросателлитов был изучен на генетическом анализаторе АВІЗ 130x1 В ходе выполнения работы были рассчитаны: среднее число аллелей (Na), эффективное число аллелей (Ne), число информативных аллелей (Na&gt;5%), наблюдаемая (Но) и ожидаемая гетерозиготность (Не), индекс фиксации (F18) а также построены генетические сети, проведены РСоА и кластерный анализы. Хакасская популяция характеризовалась наибольшим аллельным разнообразием: Na = 11,30; Ne = 5,99 и Na&gt;5% = 5,50 аллелей, тогда как минимальные Ne (3,95) и Na&gt;5% (4,30) были детектированы для первой и второй ярославских популяций соответственно. Дефицит гетерозигот от 6,0 до 19,5% был отмечен во всех группах, за исключением тульской популяции На основании результатов построения генетических сетей, РСоА и кластерного анализа была показана генетическая обособленность трех ярославских популяций, следует также отметить некоторую отдаленность рязанской популяции (1st от 0,038 до 0,059). Таким образом, нами было продемонстрировано, что параметры аллелофонда и показатели генетического разнообразия могут сильно различаться внутри одной породы. Кроме того, было установлено, что ярославские популяции романовской породы до сих пор представляют собой обособленный массив животных.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>The Romanov breed is the most interesting local Russian sheep breed with unique biological traits (out-ofseason breeding ability, prolificacy). Conservation of genetic resources of the breed requires constant careful monitoring using DNA markers. In this regard, the aim of our work was to compare the parameters of the allele pool and genetic diversity, as well as to assess genetic similarity of regional populations of the Romanov breed in comparison with archetypal animals. Tissue samples were selected in different regions of Russia (Yaroslavl, Ryazan and Tula regions, Republics of Khakassia and Komi). Polymorphism of 11 microsatellites was studied with the genetic analyzer АВІЗ 130x1. We estimated an average number of alleles (Na), effective number of alleles (Ne), number of informative alleles (Na&gt;5%), observed (Ho) and expected heterozygosity (He), fixation index (FIS), constructed Neighbour-Net and carried out PCoA and cluster analyzes. The Khakass population was characterized by the greatest allelic diversity: Na = 11.30; Ne = 5.99 and Na&gt;5% = 5.50 alleles, while minimal Ne (3.95) and Na&gt;5% (4.30) were detected for the first and second Yaroslavl populations, respectively. Deficiency of heterozygotes from 6 to 19.5% was observed in all groups, except for the Tula population. Based on the results of Neighbour-Net, PCoA and cluster analysis, genetic isolation of three Yaroslavl populations was found. Also, a certain genetic detachment of the Ryazan population (Fst from 0.038 to 0.059) was revealed. Thus, we demonstrated that the parameters of allele pool and the indices of genetic diversity can vary greatly within the breed. In addition, it has been established that the Yaroslavl populations of the Romanov breed still represent a separate group.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>генетическое разнообразие</kwd><kwd>микросатетиты</kwd><kwd>полиморфизм</kwd><kwd>овцы</kwd><kwd>романовская порода</kwd><kwd>генетика популяций</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>genetic diversity</kwd><kwd>microsatellites</kwd><kwd>polymorphism</kwd><kwd>sheep</kwd><kwd>Romanov breed</kwd><kwd>population genetics</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Справочник пород и типов сельскохозяйственных животных, разводимых в Российской Федерации. Словарь терминов по разведению, генетике, селекции и биотехнологии размножения сельскохозяйственных животных. Перечень российских и международных организаций в сфере животноводства / Дунин И.М., Данкверт А.Г. [и др.]. М.: ВНИИплем, 2013. 551 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Справочник пород и типов сельскохозяйственных животных, разводимых в Российской Федерации. Словарь терминов по разведению, генетике, селекции и биотехнологии размножения сельскохозяйственных животных. Перечень российских и международных организаций в сфере животноводства / Дунин И.М., Данкверт А.Г. [и др.]. М.: ВНИИплем, 2013. 551 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Эрнст Л.K., Дмитриев Н.Г., Паронян И.А. Генетические ресурсы сельскохозяйственных животных в России и сопредельных странах. СПб.: Изд-во ВНИИГРЖ, 1994. 469 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Эрнст Л.K., Дмитриев Н.Г., Паронян И.А. Генетические ресурсы сельскохозяйственных животных в России и сопредельных странах. СПб.: Изд-во ВНИИГРЖ, 1994. 469 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Shackelford S.D., Ley master K.A., Wheeler T.L., Koohmaraie M. Effects of breed of sire on carcass composition and sensory traits of lamb. J Anim Sсi. 2012. Vol. 90.no. 11. P. 4131.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shackelford S.D., Ley master K.A., Wheeler T.L., Koohmaraie M. Effects of breed of sire on carcass composition and sensory traits of lamb. J Anim Sсi. 2012. Vol. 90.no. 11. P. 4131.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Денискова T.E., Соловьева А.Д., Костюнина О.В., Зиновьева H.A. Динамика аллелофонда овец романовской породы на основании анализа микросателлитов // Овцы, козы, шерстяное дело. 2017. № 3. С. 5-6.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Денискова T.E., Соловьева А.Д., Костюнина О.В., Зиновьева H.A. Динамика аллелофонда овец романовской породы на основании анализа микросателлитов // Овцы, козы, шерстяное дело. 2017. № 3. С. 5-6.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics. 2012. Vol. 28. P. 2537-2539.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics. 2012. Vol. 28. P. 2537-2539.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Huson D.H., Bryant D. Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies. Molecular Biology and Evolution. 2006. Vol. 23. no. 2. P. 254-267.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Huson D.H., Bryant D. Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies. Molecular Biology and Evolution. 2006. Vol. 23. no. 2. P. 254-267.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Pritchard J. K., Stephens M., Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics. 2000. Vol. 155. P. 945-959.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Pritchard J. K., Stephens M., Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics. 2000. Vol. 155. P. 945-959.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tapio M., Таріо I., Grislis Z., Holm L-E., Jeppsson S., Kantanen J., Miceikiene I., Olsaker I., Viinalass H., Eythorsdottir E. Native breeds demonstrate high contributions to the molecular variation in northern European sheep. Mol Ecol. 2005. no. 14. P. 3951-3963.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tapio M., Таріо I., Grislis Z., Holm L-E., Jeppsson S., Kantanen J., Miceikiene I., Olsaker I., Viinalass H., Eythorsdottir E. Native breeds demonstrate high contributions to the molecular variation in northern European sheep. Mol Ecol. 2005. no. 14. P. 3951-3963.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ferrando A., Goyache F., Parés P.-М., Carrion С. Genetic relationships between six eastern Pyrenean sheep breeds assessed using microsatellites. Spanish Journal of Agricultural Research. 2014. Vol. 12. no. 4. P. 1029-1037.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ferrando A., Goyache F., Parés P.-М., Carrion С. Genetic relationships between six eastern Pyrenean sheep breeds assessed using microsatellites. Spanish Journal of Agricultural Research. 2014. Vol. 12. no. 4. P. 1029-1037.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Beynon S.E., Slavov G.T., Fane М., Sunduimijid B., Waddams K., Davies B., Haresign W., Kijas J., MacLeod I.M., Newbold C.J., Davies L., Larkin D.M. Population structure and history of the Welsh sheep breeds determined by whole genome genotyping. BMC Genet. 2015. № 16. P. 65.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Beynon S.E., Slavov G.T., Fane М., Sunduimijid B., Waddams K., Davies B., Haresign W., Kijas J., MacLeod I.M., Newbold C.J., Davies L., Larkin D.M. Population structure and history of the Welsh sheep breeds determined by whole genome genotyping. BMC Genet. 2015. № 16. P. 65.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Nei M. Genetic distance between populations. American Naturalist. 1972. no. 106. P. 283-392.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Nei M. Genetic distance between populations. American Naturalist. 1972. no. 106. P. 283-392.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tapio M., Ozerov M., Viinalass H., Kiseliova T., Kantanen Yu. Molecular genetic variation in sheep of central Volga area inhabited by Finno-Ugric peoples. Agr. Food Sсi. 2007. no. 16. P. 157-169.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tapio M., Ozerov M., Viinalass H., Kiseliova T., Kantanen Yu. Molecular genetic variation in sheep of central Volga area inhabited by Finno-Ugric peoples. Agr. Food Sсi. 2007. no. 16. P. 157-169.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Zinovieva N.A., Selionova M.I., Gladyr E.A., Petrovic M.P., Petrovic V.C., Muslik D.R., Petrovic M.M. Investigation of gene pool and genealogical links between sheep breeds of southern Russia by blood groups and DNA microsatellites. Genetika. 2015. Vol. 47. no. 2. P. 395-404.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Zinovieva N.A., Selionova M.I., Gladyr E.A., Petrovic M.P., Petrovic V.C., Muslik D.R., Petrovic M.M. Investigation of gene pool and genealogical links between sheep breeds of southern Russia by blood groups and DNA microsatellites. Genetika. 2015. Vol. 47. no. 2. P. 395-404.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Nesteruk L.V., Makarova N.N., Svishcheva G.R., Stolpovsky Yu. A. Estimation of genetic diversity of Romanov sheep by the coefficient of genetic originality based on ISSR-fingerprinting data. Russian Journal of Genetics. 2015. V. 51. P. 725-729.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Nesteruk L.V., Makarova N.N., Svishcheva G.R., Stolpovsky Yu. A. Estimation of genetic diversity of Romanov sheep by the coefficient of genetic originality based on ISSR-fingerprinting data. Russian Journal of Genetics. 2015. V. 51. P. 725-729.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Макарова H.H., Нестерук Jl.B., Столповский Ю.А., Москаленко Л.П., Николаева Е.А. Перспективы использования мультилокусных маркеров ДНК при сохранении и разведении генофонда романовской породы овец // Вестник АПК Верхневолжья. 2013. Т.2. № 22. С. 75-80.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Макарова H.H., Нестерук Jl.B., Столповский Ю.А., Москаленко Л.П., Николаева Е.А. Перспективы использования мультилокусных маркеров ДНК при сохранении и разведении генофонда романовской породы овец // Вестник АПК Верхневолжья. 2013. Т.2. № 22. С. 75-80.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
