Предложена схема селекции, предназначенная для улучшения и дифференциации короткостебельных популяционных сортов ржи, с целью получения потомств разного целевого назначения. Схема включает в себя оценку и отбор потомств от самоопыления получаемых ежегодно сорто-линейных возвратных гибридов. Источником автофертильности служит длинностебельная по генотипу линия, несущая мутацию автофертильности, маркированная изозимным локусом В прямые и возвратные скрещивания вовлечены лучшие по вегетативным признакам короткостебельные растения исходной популяции. Отбор проведен среди константных по высоте инбредных потомств по признакам, определяющим урожайность, устойчивость к полеганию, болезням и целевое назначение сорта, в последовательных поколениях возвратных гибридов. При накоплении потомств с характеристиками, удовлетворяющими требованиям селекции формируемых сортов, проводится переопыление предварительно отобранных гетерозигот по автофертильности. В полученном потомстве выделяют по маркёру самонесовместимые растения, перекрёстное опыление которых позволяет получить гетерозисные субпопуляции, константные по короткостебельности, дифференцированные по показателям качества, характеризующиеся экологической пластичностью и улучшенными характеристиками устойчивости и урожайности. Одновременно создают автофертильные аналоги открытоопыляемых субпопуляций, в которых благодаря проводимому отбору, как и в самих субпопуляциях, повышена концентрация аллелей генов, отвечающих за отбираемые признаки. Эти аналоги могут быть использованы при повторных циклах отбора и как исходный материал для селекции сортов-гибридов. Для проверки эффективности схемы провели анализ биохимических показателей зерна 122 перспективных инбредных потомств, полученных на основе сорта Снежана. Выделено 17 образцов с повышенным содержанием белка, 20 - с наибольшим содержанием крахмала, 14 образцов с наибольшим и 18 - с наименьшим по сравнению со средним значением по питомнику содержанием водорастворимых пентозанов. Часть потомств сочетает показатели, удовлетворяющие требованиям селекции сортов хлебопекарного и фуражного направлений.