Создание панели генетических маркеров для селекции по воспроизводительному фитнессу свиней крупной белой породы

В статье представлены исследования влияния SNP генов PRLR, LEP, ESR, FSHb, MC4R, LIF, POU1F1, GH на показатели воспроизводительных качеств свиней крупной белой породы. Анализ проведен с использованием линейных моделей смешанного типа. Для каждого варианта SNP применялась отдельная модель, в качестве фиксированного фактора в которой выступал генотип по рассматриваемому гену. Другим фиксированным фактором во всех моделях выступал порядковый номер опороса. Рандомизированным фактором являлись индивидуальные генотипы свиноматок. В результате анализа было установлено достоверное превосходство генотипа LEP/CC над генотипом LEP/TT по всем показателям воспроизводительных качеств: по количеству поросят при рождении на 1,55 гол. (р = 0,02), по многоплодию на 1,8 гол. (р = 0,009), по массе гнезда при рождении на 1,91 кг (р = 0,05). По гену ESR животные с генотипом ESR/ВВ также превосходили по всем рассматриваемым показателям своих аналогов с генотипом ESR/АА (по количеству поросят при рождении на 1,36 гол. (р = 0,14), по многоплодию на 0,93 гол. (р = 0,005), по массе гнезда при рождении на 2,24 кг (р = 0,15)). По гену LIF в качестве наилучшего определен генотип LIF/ВВ (количество поросят при рождении + 1,35 гол. (р = 0,15), многоплодие + 1,9 гол. (р = 0,04), масса гнезда при рождении + 2,24 кг. (р = 0,24) относительно генотипа LIF/АА). Для гена PRLR установлено превосходство генотипа PRLR/ВВ (количество поросят при рождении + 0,42 гол. (р = 0,4), многоплодие + 0,57 гол. (р = 0,25), масса гнезда при рождении +1,96 кг. (р = 0,01) относительно генотипа PRLR/АВ). Для остальных генов достоверных различий по воспроизводительным качествам между генотипами не установлено. С учетом полученных результатов разработана панель генетических маркеров для оценки воспроизводительных качеств свиней крупной белой породы. Указанная панель включает гены LEP, ESR, LIF, PRLR

свиньи, маркеры, линейные модели

1. Samorè A. B., and Fontanesi L. Genomic selection in pigs: state of the art and perspectives. Italian Journal of Animal Science, 2016, 15(2): 211-232.

2. Гетманцева Л.В., Колосов A.Ю., Леонова М.А., Бакоев С.Ю., Бакоев Н.Ф., Радюк А.В. Свидетельство о государственной регистрации базы данных. База данных аутосомных ДНК-маркеров свиней. №2015621623 (РФ) от 02.11.2015. Патентообладатель: Донской государственный аграрный университет. Заявка №2015621146 09.09.2015. Опубл. 20.11.2015, бюлл. №11(109).

3. Колосов Л.Ю., Гетманцева Л.В., Леонова М.А. Свидетельство о государственной регистрации компьютерной программы. Информационная система учета SNP-генотипов свиней по генам-маркерам продуктивности. №2015661461 (РФ)28.10.2015 Патентообладатель: Донской государственный аграрный университет. Заявка №2015618229 от 09.09.2015. Опубл. 20.11.2015, бюлл. №11(109).

4. Колосов A.Ю., Гетманцева Л.В., Леонова М.А., Бакоев С.Ю., Бакоев Н.Ф. Свидетельство о государственной регистрации компьютерной программы. BLUP-model. №2016661288 (РФ) 05.10.2016. Патентообладатель: Донской государственный аграрный университет. Заявка №2016618783 12.08.2016. Опубл. 20.11.2016, бюлл. №11(121).

5. Kim G.W., Yoo J.Y, Kim H.Y. Association of genotype of POU1F1 intron 1 with carcass characteristics in crossbred pigs. J. Anim Sci Technol 2014; 56: 25.

6. Klimenko A., Usatov A., Getmantseva L., Kolosov Yu., Tretyakova O., Bakoev S., Kostjunina O. and Zinovieva N. Effect of melanocortin-4 receptor gene on growth and meat traits in pigs raised in Russia. American Journal of Agricultural and Biological Sciences, 2014, 9(2): 232-237.

7. Park S.-J., Ha J., Kim I.-S., Kwon S.G., Hwang J.H., Park D.H., Kang D.G., Kim T.W., Kim S.W., Kim C.W., 2015. Effects of LEP, GYS1, MYOD1, and MYF5 polymorphisms on pig economic traits. J. Ann Anim Sci., 15: 1-12.

8. Omelka R., Bauerova M., Mlynek J., Buchova B., Peskovicova D., Bulla J. Effect of the estrogen receptor (ESR) gene on reproductive traits of Large White, White Meaty and Landrace pigs. Czech J. Anim. Sci., 50, 2005 (6): 249-253.

9. Piôrkowska K., Ropka-Molik K., Oczkowicz M., Rôzycki M., Zukowski K. Association study of PIT1 and GHRH SNPs with economically important traits in pigs of three breeds reared in Poland. Anim Sci Pap Rep 2013; 31: 303-314.

10. Ropka-Molik K., Variability of mRNA abundance of leukemia inhibitory factor gene (LIF) in porcine ovary, oviduct and uterus tissues. Molecular Biology Reports 39(8): 7965-7972, 2012.