Изучение генетического разнообразия и дифференциации региональных популяций романовских овец по микросателлитным маркерам

Романовская порода овец - это наиболее интересная локальная порода России, обладающая уникальными биологическими особенностями (полиэстричность, многоплодие). Сохранение генетических ресурсов данной породы требует постоянного тщательного мониторинга по ДНК-маркерам. В связи с этим, целью работы было провести сравнение параметров аллелофонда и генетического разнообразия, а также оценить генетическое сходство региональных популяций романовской породы с архетипичными животными. Образцы ткани овец были отобраны в разных регионах России (Ярославской, Рязанской, Тульской областях, республиках Хакасия и Коми). Полиморфизм 11 микросателлитов был изучен на генетическом анализаторе АВІЗ 130x1 В ходе выполнения работы были рассчитаны: среднее число аллелей (Na), эффективное число аллелей (Ne), число информативных аллелей (Na>5%), наблюдаемая (Но) и ожидаемая гетерозиготность (Не), индекс фиксации (F₁₈) а также построены генетические сети, проведены РСоА и кластерный анализы. Хакасская популяция характеризовалась наибольшим аллельным разнообразием: Na = 11,30; Ne = 5,99 и Na>5% = 5,50 аллелей, тогда как минимальные Ne (3,95) и Na>5% (4,30) были детектированы для первой и второй ярославских популяций соответственно. Дефицит гетерозигот от 6,0 до 19,5% был отмечен во всех группах, за исключением тульской популяции На основании результатов построения генетических сетей, РСоА и кластерного анализа была показана генетическая обособленность трех ярославских популяций, следует также отметить некоторую отдаленность рязанской популяции (1st от 0,038 до 0,059). Таким образом, нами было продемонстрировано, что параметры аллелофонда и показатели генетического разнообразия могут сильно различаться внутри одной породы. Кроме того, было установлено, что ярославские популяции романовской породы до сих пор представляют собой обособленный массив животных.

генетическое разнообразие, микросатетиты, полиморфизм, овцы, романовская порода, генетика популяций

1. Справочник пород и типов сельскохозяйственных животных, разводимых в Российской Федерации. Словарь терминов по разведению, генетике, селекции и биотехнологии размножения сельскохозяйственных животных. Перечень российских и международных организаций в сфере животноводства / Дунин И.М., Данкверт А.Г. [и др.]. М.: ВНИИплем, 2013. 551 с.

2. Эрнст Л.K., Дмитриев Н.Г., Паронян И.А. Генетические ресурсы сельскохозяйственных животных в России и сопредельных странах. СПб.: Изд-во ВНИИГРЖ, 1994. 469 с.

3. Shackelford S.D., Ley master K.A., Wheeler T.L., Koohmaraie M. Effects of breed of sire on carcass composition and sensory traits of lamb. J Anim Sсi. 2012. Vol. 90.no. 11. P. 4131.

4. Денискова T.E., Соловьева А.Д., Костюнина О.В., Зиновьева H.A. Динамика аллелофонда овец романовской породы на основании анализа микросателлитов // Овцы, козы, шерстяное дело. 2017. № 3. С. 5-6.

5. Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics. 2012. Vol. 28. P. 2537-2539.

6. Huson D.H., Bryant D. Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies. Molecular Biology and Evolution. 2006. Vol. 23. no. 2. P. 254-267.

7. Pritchard J. K., Stephens M., Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics. 2000. Vol. 155. P. 945-959.

8. Tapio M., Таріо I., Grislis Z., Holm L-E., Jeppsson S., Kantanen J., Miceikiene I., Olsaker I., Viinalass H., Eythorsdottir E. Native breeds demonstrate high contributions to the molecular variation in northern European sheep. Mol Ecol. 2005. no. 14. P. 3951-3963.

9. Ferrando A., Goyache F., Parés P.-М., Carrion С. Genetic relationships between six eastern Pyrenean sheep breeds assessed using microsatellites. Spanish Journal of Agricultural Research. 2014. Vol. 12. no. 4. P. 1029-1037.

10. Beynon S.E., Slavov G.T., Fane М., Sunduimijid B., Waddams K., Davies B., Haresign W., Kijas J., MacLeod I.M., Newbold C.J., Davies L., Larkin D.M. Population structure and history of the Welsh sheep breeds determined by whole genome genotyping. BMC Genet. 2015. № 16. P. 65.

11. Nei M. Genetic distance between populations. American Naturalist. 1972. no. 106. P. 283-392.

12. Tapio M., Ozerov M., Viinalass H., Kiseliova T., Kantanen Yu. Molecular genetic variation in sheep of central Volga area inhabited by Finno-Ugric peoples. Agr. Food Sсi. 2007. no. 16. P. 157-169.

13. Zinovieva N.A., Selionova M.I., Gladyr E.A., Petrovic M.P., Petrovic V.C., Muslik D.R., Petrovic M.M. Investigation of gene pool and genealogical links between sheep breeds of southern Russia by blood groups and DNA microsatellites. Genetika. 2015. Vol. 47. no. 2. P. 395-404.

14. Nesteruk L.V., Makarova N.N., Svishcheva G.R., Stolpovsky Yu. A. Estimation of genetic diversity of Romanov sheep by the coefficient of genetic originality based on ISSR-fingerprinting data. Russian Journal of Genetics. 2015. V. 51. P. 725-729.

15. Макарова H.H., Нестерук Jl.B., Столповский Ю.А., Москаленко Л.П., Николаева Е.А. Перспективы использования мультилокусных маркеров ДНК при сохранении и разведении генофонда романовской породы овец // Вестник АПК Верхневолжья. 2013. Т.2. № 22. С. 75-80.