Бактериальная микробиота желудочно-кишечного тракта овец романовской породы

Цель исследований – метабаркодинг микробиоценоза желудочно-кишечного тракта молодняка овец романовской породы, выращенных с применением пробиотика «Яросил» и без него. Исследования проведены в ООО «Юрьевское» Первомайского района Ярославской области на ягнятах романовской породы. Материалом для исследований служили образцы слизистой оболочки рубца, слепой кишки и кал ягнят контрольной и опытной групп. Проанализирована доля различных операционных таксономических единиц (ОТЕ) смешанных проб разных отделов желудочно-кишечного тракта молодняка овец. Методом высокопроизводительного секвенирования V3–V4 региона гена 16S рРНК показано доминирование представителей филумов Bacillota, Pseudomonadota, Verrucomicrobiota и Actinomycetota. Микробиота рубца ягнят контрольной группы характеризовалась значительным преобладанием бактерий рода Latilactobacillus – почти 75 %. Такая высокая концентрация бактерий может свидетельствовать об их важной роли в процессах ферментации и усвоения питательных веществ в рубце. В отличие от рубца, в кишечном микробиоме доминировали бактерии родов Nanosyncoccus и Faecousia, указывая на специализацию микробных сообществ в разных отделах пищеварительной системы. Рассчитаны индексы биологического разнообразия: индекс Шеннона варьирует от 2,55 до 5,76 в контрольной группе, от 4,65 до 6,13 – в опытной, индекс Бергера-Паркера – от 0,11 до 0,55 и от 0,09 до 0,23 соответственно.

1. Остренко К. С. Основы взаимосвязи нейрогуморальной регуляции и микробиома ЖКТ у овец. Сборник научных трудов Краснодарского научного центра по зоотехнии и ветеринарии. 2021;10(1):185–189. DOI: https://doi.org/10.48612/49x2-rm76-da6v EDN: BZIREH

2. Филинская О. В., Скворцова Е. Г., Пивоварова Е. А., Еремеева М. А. Мясные качества и интерьерные особенности помесного молодняка овец при использовании микробиологического препарата. Вестник АПК Верхневолжья. 2021;(2(54)):61–66. DOI: https://doi.org/10.35694/YARCX.2021.54.2.010 EDN: WEUCUN

3. Фомичев Ю. П., Боголюбова Н. В., Ермаков И. Ю. К вопросу управления физиологическими процессами и формированием сбалансированного микробиома в рубце коров и овец путем введения в рацион кормовых факторов с определенными биологическими и функциональными свойствами. Ветеринария, зоотехния и биотехнология. 2023;(4):88–106. DOI: https://doi.org/10.36871/vet.zoo.bio.202304009 EDN: QOZEBV

4. Лахонин П. Д., Вьючная П. С. Влияние биологически активного комплекса продуктов на рубцовое пищеварение овец. Ветеринария, зоотехния и биотехнология. 2023;(11):97–106. DOI: https://doi.org/10.36871/vet.zoo.bio.202311013 EDN: VPTPLI

5. Фомичев Ю. П., Боголюбова Н. В., Колодина Е. Н., Рыков Р. А. Регуляторное действие танинов на рубцовое пищеварение, микробиоту толстой кишки, биохимический статус и показатели неспецифического иммунитета у овец (Ovis aries). Сельскохозяйственная биология. 2025;60(2):331–344. DOI: https://doi.org/10.15389/agrobiology.2025.2.331rus EDN: OOZRCL

6. Усачев И. И., Ездакова И. Ю., Каничева И. В., Хотмирова О. В. Влияние целенаправленного формирования микробиоценоза кишечника на динамику массы тела и сохранность ягнят раннего возраста. Ветеринарный врач. 2022;(3):67–71. DOI: https://doi.org/10.33632/1998-698X.2021_67_71 EDN: PLFDNL

7. Лиходеевский Г. А., Богатова П. С., Лиходеевская О. Е. Бактериальная микробиота желудочно-кишечного тракта крупного рогатого скота молочного направления: состав, функции, значение (обзор). Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2024;25(2):159–171. DOI: https://doi.org/10.30766/2072-9081.2024.25.2.159-171 EDN: PBAZXE

8. Гиро Т. М., Ильина Л. А. Влияние обогащенных рационов на состав и функциональный профиль микробиома рубца баранчиков. Техника и технология пищевых производств. 2024;54(4):848–871. DOI: https://doi.org/10.21603/2074-9414-2024-4-2550 EDN: YDRSHS

9. Sachdeva A., Tomar T., Malik T., Bains A., Karnwal A. Exploring probiotics as a sustainable alternative to anti-microbial growth promoters: mechanisms and benefits in animal health. Frontiers in Sustainable Food Systems. 2025;8:1523678. DOI: https://doi.org/10.3389/fsufs.2024.1523678

10. Колоскова Е. М., Остренко К. С., Езерский В. А., Овчарова А. Н., Белова Н. В. Исследование микробиома рубца у овец с использованием молекулярно-генетических методов (обзор). Проблемы биологии продуктивных животных. 2020;(4):5–26. DOI: https://doi.org/10.25687/1996-6733.prodanimbiol.2020.4.5-26 EDN: VXFFAO

11. Филоненко В. А., Чачин А. В., Галкина Т. П. Эффективность кормовой добавки «Яросил» при выращивании романовских ягнят в подсосный период. Овцы, козы, шерстяное дело. 2020;(1):34–36. Режим доступа: https://elibrary.ru/item.asp?id=42579594 EDN: OHWEVP

12. Andrews S. Fast QC: a quality control tool for high throughput sequence data. Babraham Bioinformatics, Babraham Institute, Cambridge, United Kingdom, 2010. URL: https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/

13. Bolyen E., Rideout J. R., Dillon M. R., Bokulich N. A., Abnet Ch.C., Al-Ghalith G. A. et al. Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2. Nature Biotechnology. 2019;37(8):852–857. DOI: https://doi.org/10.1038/s41587-019-0209-9

14. Callahan B. J., McMurdie P. J., Rosen M. J., Han A. W., Johnson A. J., Holmes S. P. DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods. 2016;13(7):581–583. DOI: https://doi.org/10.1038/nmeth.3869

15. Chang J., Yao X., Zuo C., Qi Y., Chen D., Ma W. The gut bacterial diversity of sheep associated with different breeds in Qinghai province. BMC Veterinary Research. 2020;16(1):254. DOI: https://doi.org/10.1186/s12917-020-02477-2

16. Колесник Н. С., Зеленченкова А. А., Вьючная П. С., Артемьева О. А. Микробиологические показатели в рубце овец при скармливании разного уровня концентратов. Аграрная наука. 2024;(7):85–90. DOI: https://doi.org/10.32634/0869-8155-2024-384-7-85-90 EDN: MDHIRP

17. Liu X., Ding H., Zhang X., Ta N., Zhao J., Zhang Q. et al. Dynamic changes in the gastrointestinal microbial communities of Gangba sheep and analysis of their functions in plant biomass degradation at high altitude. Microbiome. 2025;13(1):17. DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-024-02022-5

18. Zhang Y., Cheng J., Lin C., Li F., Zhang X., Li C. et al. Spatial heterogeneity determines the gastrointestinal microbiome signatures and ecological processes that govern bacterial community assembly in sheep. Microbiology Spectrum. 2025;13(2):e01110-24. DOI: https://doi.org/10.1128/spectrum.01110-24