Preview

Аграрная наука Евро-Северо-Востока

Расширенный поиск

Полиморфизм тРНКLeu и тРНКSer митохондриальной ДНК свиней различных пород

https://doi.org/10.30766/2072-9081.2018.66.5.104-109

Полный текст:

Аннотация

Анализ последовательности митохондриальной ДНК (мтДНК), имеющей материнский характер наследования, служит эффективным способом оценки индивидуальных особенностей коммерческих линий. В работе проведен анализ вариабельности последовательностей генов тРНКSer и тРНКLeu мтДНК у свиней различных пород. В качестве объектов исследования были выбраны гены мтДНК тРНКLeuІ, тРНКLeu2, tRNASerI, tRNASer2. Для изучения последовательностей из базы National Center for Biotechnological Information (NCBI) были выбраны данные по свиньям различных пород. Выравнивание нуклеотидных последовательностей проводили с использованием программы BioEdit. Анализ последовательностей показал наличие полиморфизмов во всех изучаемых генах. Всего установлено шесть полиморфных сайтов, которые представлены транзициями. Анализ гена тРНКLeuІ показал наличие замены A/G в позиции 3892 ии у свиней китайской селекции породы Wuzhishan и свиней японской селекции Luchuan, а также замены С/T в позиции 3907 п.н. у шведского дикого кабана. По гену тРНКLeu2у большинства исследуемых пород отмечено одновременное присутствие двух транзиций в позиции 12879 п.н., что обуславливает замену А/G и в позиции 12883 п.н. и соответствует замене С/Т. В результате исследований по гену тРНКSer1 установлено наличие одной транзиции А/G в позиции 8103 п.н. у свиней крупной белой породы корейской селекции. Полиморфизм гена тРНКSer2 представлен трансзицией Т/С в позиции 12838 п.н. у итальянского дикого кабана. Наибольшее количество полиморфизмов встречалось у свиней крупной белой породы корейской и китайской селекции, а также у представителей итальянского дикого кабана. Изучение полиморфизма мтДНК племенных свиней позволит установить возможные ассоциативные связи и разработать мтДНК-маркеры, которые могут быть использованы в программах по совершенствованию и созданию племенных ресурсов в свиноводстве.

Об авторах

М. А. Колосова
ФГБОУ ВО «Донской государственный аграрный университет»
Россия


Л. В. Гетманцева
ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени. Л.К. Эрнста»
Россия


Н. Ф. Бакоев
ФГБОУ ВО «Донской государственный аграрный университет»; ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени. Л.К. Эрнста»
Россия


А. Ю. Колосов
ФГБОУ ВО «Донской государственный аграрный университет»
Россия


Список литературы

1. Getmantseva L., Kolosov A., Leonova M., Bakoev S., Klimenko A., Radyuk A., Vaselenko V., Bakoev N., Usatov A., Makarenko M. Polymorphisms in obesity-related leptin gene and its association with reproductive traits of sows. Bulgarian Journal of Agricultural Science. 2017. Т. 23. № 5. С. 843-850.

2. Kijas J.M. and Andersson L. A phylogenetic study of the origin of the domestic pig estimated from the near-complete mtDNA genome J. Mol. Evol. 52 (3), 302-308 (2001).

3. Yang J., Wang J., Kijas J., Liu B., Han H., Yu M., Yang H., Zhao S. and Li K. Genetic diversity present within the near-complete mtDNA genome of 17 breeds of indigenous Chinese pigs J. Hered. 94 (5), 381-385 (2003).

4. Ran M., Chen B. The complete sequence of the mitochondrial genome of Luchuan pig (SusScrofa) Submitted (07-AUG-2014). Department of Animal Genetics and Breeding, College of Animal Science and Technology, Furong District, Changsha, Hunan 410128, China. Р. 2071-2072.

5. Cho I.C., Park J.J., Jeon J.T. The complete sequence of mitochondrial DNA of Berkshire (Sus scrofa). Unpublished work. National Institute of Subtropical Agriculture; R.D.A., 1696, Odeung dong, Jeju 690-150, South Korea: 2004.

6. Cannon M.V., Brandebourg T.D., Kohn M.C., Ethikic D., Irwin M.H., Pinkert C.A. Mitochondrial DNA sequence and phylogenetic evaluation of geographically disparate Sus scrofa breeds Anim. Biotechnol. 26 (1), 17-28 (2015).

7. Zhang D., Liu D., Zhang X. The distribution and relationship of China domestic pig Submitted (25-APR-2014) Animal Science, Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences, Xuefu Road 368, Harbin, Heilongjiang 150086, China. Available at: https://www.ncbi. nlm.nih.gov/nuccore/JN601069.1 (accessed: 25.05.2018).

8. Frank K., Molnar J., Barta E., Marincs F. The full mitochondrial genomes of Mangalica pig breeds and their possible origin // Mitochondrial DNA Part B Mitochondrial DNA Part B. Vol. 2. pp 730-734. DOI: 10.1080/23802359.2017.1390415.

9. Yu H., Li L., Liu D. Phylogeography of Boar based on mtDNA evolution Submitted (08-DEC-2007) Animal Science and Technology College, Northeast Agricultural University, 59 Mucai Street, Harbin, HeiLon gjiang 150030, China. Available at: https://www.ncbi. nlm.nih. gov/nuccore/EU333163.1 (accessed: 4.06.208).

10. Alves E., Fernandez A.I., Ovilo C., Fernandez A., Rodriguez C., Sileo L. Variation in mtDNA Iberian breed Submitted (23-AUG-2007) Mejora Genetica Animal, INIA, Ctra de la Coruna Km7, Madrid 28040, Spain. Available at: https://www.ncbi. nlm.nih.gov/nuccore/


Для цитирования:


Колосова М.А., Гетманцева Л.В., Бакоев Н.Ф., Колосов А.Ю. Полиморфизм тРНКLeu и тРНКSer митохондриальной ДНК свиней различных пород. Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2018;66(5):104-109. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2018.66.5.104-109

For citation:


Kolosova M.A., Getmantseva L.V., Bakoev N.F., Kolosov A.Yu. Mitochondrial DNA tRNALeu and tRNASer polymorphism in different pig breeds. Agricultural Science Euro-North-East. 2018;66(5):104-109. (In Russ.) https://doi.org/10.30766/2072-9081.2018.66.5.104-109

Просмотров: 224


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2072-9081 (Print)
ISSN 2500-1396 (Online)