Неравновесное сцепление (гаметическое неравновесие) структурных генов в популяции крупного рогатого скота
https://doi.org/10.30766/2072-9081.2021.22.3.401-408
Аннотация
В популяции крупного рогатого скота холмогорской породы (n = 824) исследовали гаметическое неравновесие по аллелям полиморфных локусов β-Lg (LGB), β-Cn (CSN2) и æ-Cn (CSN3). У чистопородного холмогорского скота полиморфизм β-казеина детерминирован тремя аллелями с частотами встречаемости CSN2А1 – 0,368±0,0076, CSN2А – 0,497±0,0078, CSN2 B – 0,136±0,0056; æ-казеина соответственно CSN3A – 0,689±0,0061, CSN3 В – 0,311±0,0061. Полиморфизм β-лактоглобулина контролируется двумя аллелями LGBА и LGBВ с частотой встречаемости соответственно 0,237±0,0048 и 0,763±0,0048. В популяции племенных заводов выявлено гаметическое неравновесие по аллелям локусов CSN2 и LGB, CSN2 и CSN3. Первичной причиной возникновения гаметического неравновесия, видимо, послужило исходное различие аборигенного русского и черно-пёстрого скота Западной Европы, на основе которых формировался генофонд холмогорской породы. В популяции выявлен избыток гаплотипов β-CnВæ-CnВ, β-CnВβ-LgВ (фаза «притяжения»), видимо, характерных для аборигенного русского скота и β-CnА 1æ-CnА, β-CnА 2β-LgА, в большей степени свойственных черно-пёстрому скоту Западной Европы и недостаток β-CnВæ-CnА, β-CnВβ-LgА (фаза «отталкивания»), обусловленный низкой частотой встречаемости этих гаплотипов у обеих исходных пород. Обсуждается роль различных факторов в возникновении и поддержании гаметического неравновесия. Высказано предположение, что длительное сохранение в популяции гаметического неравновесия по аллелям не сцепленных локусов, скорее всего, поддерживается отбором.
Об авторах
В. С. Матюков
Институт агробиотехнологий им. А. В. Журавского Коми НЦ УрО РАН
Россия
Россия
Матюков Валерий Самуилович, кандидат биол. наук, ведущий научный сотрудник лаборатории геномики
ул. Ручейная, д. 27, г. Сыктывкар, Республика Коми, 167023
В. Г. Зайнуллин
Институт агробиотехнологий им. А. В. Журавского Коми НЦ УрО РАН
Россия
Россия
Зайнуллин Владимир Габдуллович, ведущий научный сотрудник лаборатории геномики
ул. Ручейная, д. 27, г. Сыктывкар, Республика Коми, 167023
Список литературы
1. Mueller J. C. Linkage disequilibrium for different scales and applications. Briefings in Bioinformatics. 2004;5(4):355-364. DOI: https://doi.org/10.1093/bib/5.4.355
2. Qanbari S., Rubin C.-J., Maqbool K., Weigend S., Weigend A., Geibel J. et al. Genetics of adaptation in modern chicken. PloS Genet. 2019;15(4):e1007989. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1007989
3. Кленовицкий П. М., Багиров В. А., Марзанов Н. С., Зиновьева Н. А. Генные карты сельскохозяйственных животных. Дубровицы, 2003. 58 с. Klenovitskiy P. M., Bagirov V. A., Marzanov N. S., Zinov'eva N. A. Gennye karty sel'skokhozyaystvennykh zhivotnykh. [Gene maps of farm animals]. Dubrovitsy, 2003. 58 p.
4. Матюков В. С. Селекционный статус полиморфизма β-казеина у крупного рогатого скота. Сельскохозяйственная биология. 1983;18(2):73-78. Matyukov V. S. Selektsionnyy status polimorfizma β-kazeina u krupnogo rogatogo skota. [Breeding status of β-casein polymorphism in cattle]. Sel'skokhozyaystvennaya biologiya = Agricultural Biology. 1983;18(2):73-78. (In Russ.).
5. Aschton C. C., Gilmour D. C., Kiddy C. A., Kristjansson P. K. Proposals on nomenrlature of protain polimorfisms in farm livestok. Genetics. 1967;56(3):353-362.
6. Kantanen J., Edwards C. J., Bradley D. G., Viinalass H., Thessler S., Ivanova Z., Kiselyova T., Cinkulov M., Popov R., Stojanovic S. Maternal and paternal genealogy of Eurasian taurine cattle (Bos taurus). Heredity. 2009;103(5):404-415. DOI: https://doi.org/10.1038/hdy.2009.68
7. Meng-Hua Li. Tapio I., Villkki J., Ivanova Z., Kiselyova T., Marzanov N., Ctnkulov M., Stojanovic S., Ammosov I., Popov R., Kantanen Ju. The genetic structure of cattle populations (Bos taurus) in northern Eurasia and the neighbouring. Near Eastern regions: implications for breeding strategies and conservation. Molecular Ecology. 2007;16(18):3839-3853. DOI: https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2007.03437.x
8. Матюков В. С., Жариков Я. А., Миронов В. В. Методы современной селекции и сохранение генофонда молочного скота в Республике Коми. Сыктывкар, 2012. 156 с. Matyukov V. S., Zharikov Ya. A., Mironov V. V. Metody sovremennoy selektsii i sokhranenie genofonda molochnogo skota v Respublike Komi. [Methods of modern breeding and preservation of the gene pool of dairy cattle in the Komi Republic]. Syktyvkar, 2012. 156 p.
9. Hines H. C., Zikakis J. P., Haenlain G. F. W. Linkage relationship among loci of polymorphism in blood and milk of cattle. J. Dairy Sc. 1981;64(1):71-76.
10. Маринчук Г. Е. Сопряженность молочной продуктивности крупного рогатого скота с комплексом локусов сцепленного блока казеинов и β-лактоглобулина. Цитология и генетика. 1992;26(5):48-53. Marinchuk G. E. Sopryazhennost' molochnoy produktivnosti krupnogo rogatogo skota s kompleksom lokusov stseplennogo bloka kazeinov i β-laktoglobulina. [Conjugation of milk productivity of cattle with a complex of loci of a linked block of caseins and β-lactoglobulin]. Tsitologiya i genetika = Cytology and genetics. 1992;26(5):48-53. (In Ukraine).
11. Hayes B. J., Visscher P. M., McPartlan H. C., Goddard M. E. Novel multilocus measure of linkage disequilibrium to estimate past effective population size. Genome Res. 2003;13(4):635-643. DOI: https://doi.org/10.1101/gr.387103
12. Patil N., Berno A. J., Hinds D. A. Blocks of limited haplotype diversity revealed by highresolution scanning of human chromosome 21. Science. 2001;294(5547):1719-1723.
13. Melese L. Marker Assisted Selection in Comparison to Conventional Plant Breeding: Review Article. Agri Res & Tech: Open Access J. 2018;14(2):555914. DOI: https://doi.org/10.19080/ARTOAJ.2018.14.555914
14. Slatkin M. Linkage disequilibrium − understanding the evolutionary past and mapping the medical future. Nat. Rev. Genet. 2008;9(6):477-485. DOI: https://doi.org/10.1038/nrg2361
15. Kantanen J., Løvendahl P., Strandberg E., Eythorsdottir E., Li M. H, Kettunen-Præbel A., Berg P., Meuwissen T. Utilization of farm animal genetic resources in a changing agro-ecological environment in the Nordic countries. Front Genet. 2015;6(2):52. DOI: https://doi.org/10.3389/fgene.2015.00052
16. Amaral A. J, Pavão A. L., Gama L. T. Genomic Tools for the Conservation and Genetic Improvement of a Highly Fragmented Breed-The Ramo Grande Cattle from the Azores. 2020;10(6):1089. DOI: https://doi.org/10.3390/ani10061089
17. Strandén I., Kantanen J., Russo I. M., Orozco-terWengel P., Bruford M. W. Genomic selection strategies for breeding adaptation and production in dairy cattle under climate change. Climgen Consortium. Heredity (Edinb). 2019;123(3):307-317. DOI: https://doi.org/10.1038/s41437-019-0207-1
Рецензия
При поддержке: Работа выполнена при поддержке Минобрнауки РФ в рамках Государственного задания № 0412-2019-0051 (Рег. № НИОКТР АААА-А20-120022790009-4). Авторы благодарят рецензентов за их вклад в экспертную оценку данной работы
Для цитирования:
Матюков В.С., Зайнуллин В.Г. Неравновесное сцепление (гаметическое неравновесие) структурных генов в популяции крупного рогатого скота. Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2021;22(3):401-408. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2021.22.3.401-408
For citation:
Matyukov V.S., Zainullin V.G. Disequilibrium linkage (gametic disequilibrium) of structural genes in the bovine population. Agricultural Science Euro-North-East. 2021;22(3):401-408. (In Russ.) https://doi.org/10.30766/2072-9081.2021.22.3.401-408
Просмотров: 286
Послать статью по эл. почте 