Preview

Аграрная наука Евро-Северо-Востока

Расширенный поиск

Локусы панели генотипирования секвенированием по технологии AgriSeq в породе манычский меринос

https://doi.org/10.30766/2072-9081.2023.24.5.849-857

Полный текст:

Аннотация

С использованием генотипирования баранов породы манычский меринос на базе Illumina BeadChip Ovine 600K были обнаружены локусы, пригодные для генотипирования секвенированием животных этой породы. Выявлены однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) с высокой частотой встречаемости в диапазоне 0,2850-0,3149 гомозигот как диких, так и мутантных вариантов. Гетерозиготные варианты этих замен встречались с частотой 0,379±0,012. Количество соответствующих выбранным критериям полиморфизмов составило 521. Анализ расположения обнаруженных SNP в геноме овец показал их наличие по всей длине генотипируемой области ДНК. Наибольшее количество полиморфизмов находилось на 1, 2, 3, 17 и Х хромосомах. Меньше всего полиморфизмов выявлено на 18, 21, 24 и 25 хромосомах. Полученный набор замен позволит эффективно решать задачи подтверждения достоверности происхождения овец породы манычский меринос, точно идентифицировать животных в процессе селекционной работы, проводить учет инбридинга в популяции. Предложенный нами набор SNP рекомендуется как для использования в генотипировании секвенированием нового поколения, так и для кастомизации SNP-биочипов.

Для цитирования:


Криворучко А.Ю., Лиховид А.А., Каниболоцкая А.А., Саприкина Т.Ю., Кухарук М.Ю., Яцык О.А. Локусы панели генотипирования секвенированием по технологии AgriSeq в породе манычский меринос. Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2023;24(5):849-857. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2023.24.5.849-857

For citation:


Krivoruchko A.Yu., Likhovid A.A., Kanibolotskaya A.A., Saprikina T.Yu., Kuharuk M.Yu., Yatsyk O.A. Loci of the genotyping panel by sequencing using AgriSeq technology in the Manych Merino breed. Agricultural Science Euro-North-East. 2023;24(5):849-857. (In Russ.) https://doi.org/10.30766/2072-9081.2023.24.5.849-857

Просмотров: 182


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2072-9081 (Print)
ISSN 2500-1396 (Online)