Молекулярно-биологическая характеристика разнообразия стрептомицетов в почвах саксаулового леса Монголии
https://doi.org/10.30766/2072-9081.2021.22.1.85-92
Аннотация
Саксаул (Haloxylon ammodendron) – растение с широким экологическим диапазоном, формирует в Монголии леса, которые используются как пастбища для верблюдов. Из почв саксаулового леса с помощью селективных приемов выделены актиномицеты. По результатам филогенетического анализа на основе последовательностей фрагмента гена 16S рРНК установлено, что полученные изоляты относятся к роду Streptomyces. По своему таксономическому положению штаммы (M41; M42; М 43; С 4-46; С 4-47; С 4-50; М44; С 5-54; С5-60 и С 5-63) демонстрируют высокий уровень (99,20-100 %) сходства последовательностей гена 16S рРНК с типовым штаммами видов: S. fradiae, S. huasconensis, S. Coe-ruleoprunus, S. tendae, S. rubrogriseus, S. malachitofuscus, S. Flavoviridis, S. pilosus, S. caelestis, S. azureus, S. fulvissimus, S. microflavus, S. griseussubsp. griseus, S. anulatus, S. cyaneofuscatus, S. luridiscabiei, S. halstedii, S. fulvorobeus, S. pratensis, S. setonii, S. anulatus, S. pratensis, S. caelestis и S. azureus.
Об авторах
Ж. Норовсурэн
Институт биологии Академии наук Монголии
Монголия
Монголия
Норовсурэн Жадамбаа, доктор биол. наук, ведущий научный сотрудник лаборатории микробиологии
Проспект Мира-54Б, Баянзурхский район, г. Улан-Батор, 13330
Liu Shao-Wei
Институт медицинской биотехнологии, Китайская академия медицинских наук и Медицинский колледж Пекинского союза
Китай
Китай
Shao-Wei Liu, доцент
г. Пекин, 100050
Sun Cheng-Hang
Институт медицинской биотехнологии, Китайская академия медицинских наук и Медицинский колледж Пекинского союза
Китай
Китай
Cheng-Hang Sun, профессор и декан факультета химии микробов
г. Пекин, 100050
Б. Алтансух
Институт Ботанического сада Академии наук Монголии
Монголия
Монголия
Алтансух Батбаатар, магистр, научный сотрудник
Проспект Мира-54А, Баянзурхский район, г. Улан-Батор, 13330
Ч. Доржсурэн
Институт Ботанического сада Академии наук Монголии
Монголия
Монголия
Доржсурэн Чимидням, профессор, академик
Проспект Мира-54А, Баянзурхский район, г. Улан-Батор, 13330
Список литературы
1. Доржсурэн Ч. Антропогенные сукцессии в лиственничных лесах Монголии: монография. М.: Изд-во Института проблем экологии и эволюции им. А. Н. Северцова, 2009. С. 209.
2. Гал Ж. Об изучении саксауловых пастбищ и их ботанические характеристики. Труды института биологии АН МНР. 1969;(3):177-191.
3. Цаценкин И. А., Юнатов А. А. Естественные кормовые ресурсы Монгольской народной республики. Восточная часть Гоби. Труды монгольской комиссии. М.: Изд-во АНССР, 1951. Вып.40. 350 с.
4. Юнатов А. А. Заметки о саксауле в Монголии. Ученые записки Монгольского ГУ. Улан-Батор, 1946. Вып. 1. С 93- 97.
5. Калакуцкий Л. В., Агре Н. С. Развитие актиномицетов. М.: Наука, 1977. 287с.
6. Звягинцев Д. Г., Зенова Г. М. Экология актиномицетов. М.: ГЕОС, 2001. 257 с.
7. Hayakawa M., Nonomura H. Humic acid-vitamin agar, a new medium for the selective isolation of soil actinomycetes. Journal of Fermentation Technology.1987;65(5):501-509.
8. Зенова Г. М. Почвенные актиномицеты редких родов. М., 2000. 81 с.
9. Гаузе Г. Ф., Преображенская Т. П., Свешникова М. А., Терехова Л. П., Максимова Т. С. Определитель актиномицетов. М., 1983. 245 с.
10. Shirling E. B.,Gottlieb D. Methods for characterization of Streptomyces species. International Journal of Systematic Bacteriology. 1966;16(3):313-340. DOI: https://doi.org/10.1099/00207713-16-3-313
11. Определитель бактерий Берджи: В 2 т. Под ред. Дж. Хоула и др. М., 1997. 800 с.
12. Hasegawa Т., Takizawa M., Tanida S. A rapid analysis for chemical grouping of aerobic actinomycetes. J. Gen. Appl. Microbiol. 1983;29(4):319-322. DOI: https://doi.org/10.2323/jgam.29.319
13. Li W. J., Xu P., Schumann P., Zhang Y. Q., Pukall R., Xu L. H., Stackebrandt E., Jiang Ch. L. Georgenia-ruaniisp.nov., anovelactinobacterium isolated from forest soil in Yunnan (China) and emended description of the genus Georgenia. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007;57(7):1424-1428. DOI: https://doi.org/10.1099/ijs.0.64749-0
14. Liu Q. Q., Wang Y., Li J., Du Z. J., Chen G. J. Saccharicriniscarchari sp. nov., isolated from a shark, and emended descriptions of the genus Saccharicrinis and Saccharicrinisfermentans. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2014;64(7):2204-2209. DOI: https://doi.org/10.1099/ijs.0.061986-0
15. Yoon S. H., Ha S. M., Kwon S., Lim J., Kim Y., Seo H., Chun J. Introducing EzBioCloud: a taxonomically united database of 16S rRNA gene sequences and whole-genome assemblies. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2017;67(5):1613-1617. DOI: https://doi.org/10.1099/ijsem.0.001755
16. Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular Biology and Evolution. 2016;33:1870-1874. DOI: https://doi.org/10.1093/molbev/msw054
17. Saitou N., Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. MolBiolEvol. 1987;4(4):406-425. DOI: https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040454
18. 18. Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. Journal of Molecular Evolution. 1980;16:111-120. DOI: https://doi.org/10.1007/BF01731581
19. Felsenstein J. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution. 1985;39:783-791.
20. Норовсурэн Ж., Костина Н. В. Редкий род актиномицетов Actinomadurasp. в почвах саксаульного леса (Haloxylon ammodendron) Монголии.Доклады ТСХА: сб. статей. М.: Изд-во РГАУ – МСХА имени К. А. Тимирязева, 2020. Вып. 292. Ч.IV.С.78-80. Режим доступа: https://www.timacad.ru/uploads/files/20200706/1594041128_vipusk_292-IV.pdf
21. Норовсурэн Ж., Шульга-Михайлова Н. В., Зенова Г. М., Звягинцев Д. Г. Актиномицеты в почвах Монголии. Почвоведение. 2002;(2):198-204.
22. Aidan C. Parte. LPSN−list of prokaryotic names with standing in nomenclature. Nucleic Acids Research. 2014;42(D1):D613–D616. DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkt1111
23. Дорошенко Е. А., Зенова Г. М., Звягинцев Д. Г., Судницын И. И. Прорастание спор и рост мицелия стрептомицетов при разных уровнях влажности. Микробиология. 2005;74(6):795-799.
24. Дорошенко Е. А., Норовсурэн Ж., Зенова Г. М. Прорастание спор и рост мицелия актиномицетов, выделенных из почв Монголии, при разных уровнях влажности. Четверть века на страже плодородия: мат-лы Международн. научн.-практ. конф. Белгород, 2006. С. 82-84.
25. Eftekharivash L., Hamedi J., Zarrini Gh., Bakhtiari R. Introducing acidophilic and acid tolerant actinobacteria as new sources of antimicrobial agents against Helicobacter pylori. Archives of Razi Institute. 2020;76(2). DOI: https://doi.org/10.22092/ari.2019.128039.1401
26. Arai Y., Iinuma H., Ikeda Y., Igarashi M., Hatano M., Kinoshita N., Ukaji T., Simizu S., Umezawa K. Migracins A and B, new inhibitors of cancer cell migration, produced by Streptomyces sp. J. Antibiotics (Tokyo) 2013;66(4): 225-230. DOI: http://dx.doi.org/10.1038/ja.2012.112
Рецензия
При поддержке: Работа выполнена при поддержке инновационного фонда CAMS для медицинских наук (грант № CAMS 2017-12M-B & R-08) и гранта Академии наук Монголии 2018/10. Выражаем благодарность младшему научному сотруднику Е. П. Никитиной Байкальского института природопользования СО РАН за её участие в наших исследованиях. Авторы благодарят рецензентов за их вклад в экспертную оценку этой работы.
Для цитирования:
Норовсурэн Ж., Shao-Wei L., Cheng-Hang S., Алтансух Б., Доржсурэн Ч. Молекулярно-биологическая характеристика разнообразия стрептомицетов в почвах саксаулового леса Монголии. Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2021;22(1):85-92. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2021.22.1.85-92
For citation:
Norovsuren J., Shao-Wei L., Cheng-Hang S., Altansukh B., Dorjsuren C. Molecular and biological characteristics of streptomyces diversity in the soils of the Saxaul forest in Mongolia. Agricultural Science Euro-North-East. 2021;22(1):85-92. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2021.22.1.85-92
Просмотров: 383
Послать статью по эл. почте 